光学的手法を用いて、細胞や組織内の分子局在や形態の変化を静的・動的に解析することにより、病原体の感染成立機構等を明らかにし、治療・予防法の開発に資する研究を支援する。共同利用機器として、共焦点レーザー/超解像度顕微鏡システム（Elyra.PS.1 + LSM 780、 ZEISS）共焦点レーザー/蛍光顕微鏡（AXR、Nikon）、共焦点レーザー/蛍光顕微鏡（A1R、Nikon）、イメージングフローサイトメーター（Image Stream MKII、Luminex）、バーチャルスライドスキャナ（NanoZoomer 2.0-RS、浜松ホトニクス）が利用可能である。共焦点レーザー/蛍光顕微鏡、イメージングフローサイトメーター、バーチャルスライドスキャナは、2015年4月に開設された長崎大学ニコン感染症イメージング・コアラボラトリーに設置されており、管理・利用補助を担当している（担当：見市・坂口・浦・2024年4月1日現在）。

▶ 光学顕微鏡室使用上の注意（課金制度説明含む）（PDF）