本施設は，熱帯医学領域で取り扱う病原体の，感染に関する研究に必要な動物実験，および病原体（株）の動物による継代保存などを行う目的で，昭和５２年度に新築，昭和５４年度から省令施設となった。昭和６２年度には３階部分が増築された。感染動物飼育室７，感染実験室２，中間宿主と媒介昆虫飼育室の各１室，組換えDNAを用いた動物実験が可能な，P３レベル感染実験室と飼育室を有する。施設内はすべて陰圧に保たれ，排気はすべてHEPAフィルターによる濾過を行って，病原体の室内からの拡散を阻止している。使用水は，塩素消毒を行った後に排水される。飼育されている動物はマウス，ハムスター，ラット，スナネズミ，ウサギ，及び貝である。動物の飼育管理と実験は，長崎大学動物実験指針に沿って行われている。ウイルス，細菌，原虫，寄生虫，感染生化学，環境生理および臨床の各分野が本施設を利用している。平成１１年度の利用者数は延べ４，５０８人，飼育動物の延べ数は，６９８，５６５個体であった。